南京医科大学研究生党工委成立于2022年1月，是在学校学生工作本研一体化改革大背景下产生，是原研究生院党委、研工部部分职能的延续。研究生党工委负责全校研究生党建工作指导，是在南京医科大学校外培养单位学习的研究生党员之家，下设党支部23个，现有党员280多名。